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** Single Cell RNA-Seq Service **
| Sample Requirement |
~250,000 cells (>500 cells/μl로 500ul 이상 in media), Tissue 200 mg 이상+ |
| Library Method |
10X Genomics Next GEM technology |
| NGS Run Format |
NovaSeq 6000, PE100bp |
| Number of Target Cell++ |
3,000 ~ 10,000 cells |
| Data Yield++ |
~50,000 Paired Reads per cell |
| Turnaround Time |
~5 weeks after Cell count & QC |
+ Tissue Dissociation은 상담 후 진행 가능
++ Target cell수, Data Yield는 상의하여 조정 가능 |
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Single Cell RNA-Seq Data Analysis
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WinSeurat는 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. Windows PC 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도록 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되어 연구자들이 보다 쉽고 편하게 데이터 마이닝과 이미지를 제작할 수 있습니다.
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ExSCEA(Excel based Single Cell Expression Analysis)는 연구자들이 Single cell RNA-seq 데이터를 보다 쉽고 직관적으로 다룰 수 있도록 만든 엑셀 기반의 분석 도구입니다. Single cell RNA-seq의 분석 결과로부터 ExSCEA를 이용하여 유용한 정보를 얻을 수 있습니다. ExSCEA는 사용자들의 요구사항을 지속적으로 반영하여 엑셀 사용에 익숙하지 않은 연구자들도 쉽게 사용할 수 있도록 지속적으로 업데이트 될 예정입니다.
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