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GeoMx Spatial Service
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Service Name
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GeoMx Spatial WTA* Service
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GeoMx IO** Proteome Service
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Species
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Human, Mouse
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Human
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Number of Gene
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Human ~18,000개 / Mouse ~22,000개
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Human ~570개
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Sample type
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Tissue (FFPE, Tissue microarray, Fresh frozen tissue, Core needle biopsy etc,.)
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Sample size
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14.1 x 35.1 mm
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Turnaround time
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~3 weeks after ROI selection
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Publication
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NanoString GeoMx Publication
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* WTA (Whole Transcriptome Atlas) / ** IO (Immuno-Oncology Biomarker)
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Spatial Transcriptome Data Analysis with ExDEGA
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GeoMx Spatial trascripotme/proteome 분석은 조직내에서 세포의 morphology를 확인하고 원하는 영역/세포 타입에 대한 유전자 또는 단백질 발현값을 확인 할수 있습니다.
Human/Mouse의 대부분의 조직에서 실험가능하며 ExDEGA report(DEG analysis)외에도 PCA, tSNE, UMAP, Deconvolution, Bar Graphs, Box plots과 같은 다양한 visualization을 제공하고 있습니다.
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Proteomics 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다. ExDEGA 분석툴은 이바이오젠에서 제공하는 RNA-seq 및 Microarray 데이터(엑셀 파일)에서만 사용하실 수 있습니다.
세부정보 >> Software & Data Analysis
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