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Title (2024년 1분기)Spatial transcriptome & scRNA-Seq 데이터분석 워크샵 안내
Writer Admin
Date 2023-12-28
Attached File
Spatial transcriptome & scRNA-Seq 연구자를 위한
GeoMx & RNA-seq / Single cell RNA-Seq
무료 데이터분석 워크샵 안내
  • 대상자 : GeoMx & RNA-Seq, scRNA-Seq 고객 및 국내 연구자
  • 참석인원 제한 : 한 Class에 최대 16명, Lab당 1명
  • 2024년 1분기 분석워크샵 일정
    •   - GeoMx & RNA-Seq : 1월 17일(수), 3월 20일(수)
     - Single cell RNA-Seq : 1월 18일(목), 3월 21일(목)
      ※ 교육시간 : 오후 2시 ~ 5시 30분 (약 3시간 30분)
    이번에 진행하는 분석워크샵은 대면 방식으로 이바이오젠 본사에서 진행하고 원활한 진행을 위해 인원을 제한하오니 양해 부탁드립니다. 더불어 아래 동영상을 미리 시청하고 RNA-Seq 데이터 분석을 예습해 주시면 감사하겠습니다.
    [동영상]RNA-Seq 데이터분석(ExDEGA_v5.0 사용법 설명)
    [동영상]RNA-Seq 데이터분석(ExDEGA GraphicPlus 사용법 설명)
    [동영상]Single Cell RNA-Seq 데이터분석(WinSeurat_v3.0 소개 및 Data Mining)
    **신청방법 및 세부사항**
    신청방법 신청서 작성후 이메일로 신청
    신청서 다운로드(클릭)     		교육시간 오후 2시(약 3시간 30분 소요)
    분석워크샵 장소 (주)이바이오젠 본사 대회의실
    서울특별시 성동구 뚝섬로17가길 48 성수에이원센터 4층 406호     		준비사항 노트북(마우스 포함)
    프로그램 설치 및 샘플데이터 다운로드(신청확정 후 안내)
    **분석 워크샵 교육내용**
    GeoMx & RNA-seq Single cell RNA-Seq
    1. GeoMx Spatial Transcriptome 개요
    2. 분석 실습 1부
     - GeoMx 결과 포맷 & ExDEGA 를 활용한 RNA-seq 발현분석
    3. 분석 실습 2부
     - RNA-seq 추가분석 (GSEA, Cytoscape Network)     		1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석소개
    2. 분석 실습 1부
     - 10x Loupe Browser 활용한 발현분석 및 cell type identification
     - ExSCEA Report 활용한 scRNA 발현분석
    3. 분석 실습 2부
     - WinSeurat 활용한 scRNA-Seq customized option 적용 분석
    ExDEGA & WinSeurat 분석툴
    ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Proteomics 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다. ExDEGA 분석툴은 이바이오젠에서 제공하는 RNA-seq 및 Microarray 데이터(엑셀 파일)에서만 사용하실 수 있습니다.
    세부정보 >> Software & Data Analysis
    WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.
    세부정보 >> Software & Data Analysis

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