News&Event

Title Windows에서 쉽고 간단한 scRNA-seq 데이터분석 지원
Writer Admin
Date 2023-11-22
Attached File
Windows에서 쉽고 간단하게 scRNA-seq 데이터를 분석하세요!
Single Cell RNA-seq 데이터분석 할인행사
▶ 할인 행사기간 : 2023년 11월 22일 ~ 2023년 12월 31일
▶ 실험분석 서비스 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
scRNA-seq 데이터 분석
scRNA-Seq 데이터 분석 의뢰는 보유하고 있는 Cell Ranger out file 파일을 제공해 주시면 이바이오젠에서 데이터 분석을 서비스로 제공
- Data Analysis : WinSeurat, ExSCEA
- 할인 서비스 가격 : 50만원/Sample (부가세별도)
** raw data(Fastq file)부터의 분석은 별도 문의
WinSeurat Pro 프로그램 별도 구매 가능
WinSeurat Pro는 이바이오젠 홈페이지에서 주문하시면 24시간 이내(평일기준)에 "ID와 Password"를 이메일로 발송
100만원(부가세별도)/1PC-1Year
구매하기
ExSCEA 주요기능 WinSeurat & WinSeurat Pro 주요기능
- HVG (Highly Variable Genes), Cell Type, Gene Ontology 분석
- Cluster 별 Significant data analysis
- Volcano Plot 작성 및 gene marking
- Venn Diagram 분석 및 해당 영역 gene filtering
- ExDEGA GraphicPlus 연동 및 기능사용
- KEGG Mapper – Search&Color Pathway Support
- MeV Clustering Heat map Support
- DAVID Functional Annotation Support
-Selected genes 발현 패턴 그래프 작성 		- Windows OS 환경에서 프로그램 구동
- 단일 샘플 또는 여러 샘플을 통합하여 분석 진행
- Single cell data quality control 및 Cell filtering
- Customized UMAP/TSNE Clustering (PCA, Resolution)
- Cluster에서 유의한 Marker gene identification
- Cluster에 대한 개별 Gene expression level 시각화
- Cluster의 Marker gene과 Cell type assignment
- Cluster 또는 Condition에 따른 비교그룹 분석
- Differential expression 및 Volcano plot visualization
- Cell cycle 패턴에 따라 Regress 진행여부 선택
- Database 기반의 자동 Cell type identification 분석
- 관심있는 유전자 발현패턴 시각화 (Ridge, Dot plot)
Single cell RNA-seq DATA analysis
ExSCEA(Excel based Single Cell Expression Analysis)는 연구자들이 Single cell RNA-seq 데이터를 보다 쉽고 직관적으로 다룰 수 있도록 만든 엑셀 기반의 분석 도구입니다. Single cell RNA-seq의 분석 결과로부터 ExSCEA를 이용하여 유용한 정보를 얻을 수 있습니다. ExSCEA는 사용자들의 요구사항을 지속적으로 반영하여 엑셀 사용에 익숙하지 않은 연구자들도 쉽게 사용할 수 있도록 지속적으로 업데이트 될 예정입니다.
세부정보 >> Software & Data Analysis

WinSeurat는 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. Windows PC 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도록 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되어 연구자들이 보다 쉽고 편하게 데이터 마이닝과 이미지를 제작할 수 있습니다.
세부정보 >> Software & Data Analysis

List