News & Event Detail
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RNA-Seq & Single cell RNA-Seq 데이터분석 무료 워크샵 일정 안내
대상자 : RNA-Seq, scRNA-Seq 고객 및 국내 연구자
참석인원 제한 : (최대 10명, Lab당 2명 이내)/Class, 한개 Class만 신청가능 코로나19 대응 사회적 거리두기로 최소인원만 교육
2020년 11월, 12월 분석워크샵 일정
▶ RNA-Seq(Advanced) : 11 월 19일(목), 12월 17일(목)
▶ Single cell RNA-Seq : 11월 12일(목), 12월 10일(목)
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신청방법 및 세부사항
분석 워크샵 교육내용
RNA-Seq Advanced Class
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Single cell RNA-Seq
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ExDEGA 분석툴 유경험자 대상으로 GSEA, MeV, Cytoscape 프로그램 교육
- 1부 -
ExDEGA 데이터분석 개요
MeV(Clustering) 프로그램 활용
GSEA 프로그램 활용
- 2부 -
Cytoscape-String Network 활용
Cytoscape-ClueGO 활용
Cytoscape-Custom Network 활용
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1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석(Cell Ranger, Seurat) 안내
2. ExSCEA 이용 발현분석 : Cell Ranger 분석 기반의 ExSCEA, Loupe를 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
3. WinSeurat 활용 : WinSeurat 분석툴을 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
(QC, Normalization, PCR, SCTransform, Integration, Clustering, Marker Identification, DE Analysis)
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분석워크샵 신청 및 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
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ExDEGA & WinSeurat Screenshot
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Microarray 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다.
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WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.
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