Genome Sequencing이 완료된 생물종을 대상으로 RNA를 분리하여 NGS 기술을 통해 전사체(transcriptome) 분석을 수행해 드립니다. mRNA expression profiling 분석 이외에도 lncRNA, isoform, INDEL, Alternative Splicing Event, Gene fusion 등 다양한 분석을 지원합니다.

Service Info.
total RNA-Seq mRNA-Seq
Sample requirement >2ug total RNA >2ug total RNA
Library method RiboCop rRNA Depletion
+ SMARTer stranded RNA-Seq kit HT
Poly(A) RNA Selection
+ SMARTer stranded RNA-Seq kit HT
NGS run format HiSeq 2000/2500, PE100 HiSeq 2000/2500, PE100
Data yield >6Gb/sample >4Gb/sample
Turnaround time ~6주 ~5주
Sample type Tissue, Cell, Whole Blood(Paxgene), Plant, Fungi, Bacteria, etc.

++ RNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • RNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis
Basic Analysis Optional Analysis
Lnc RNA mRNA expression Isoform expression INDEL Analysis Novel transcript Gene fusion Splicing variant Exon profiling
Total
RNA-Seq
O O O O O O O O
mRNA-Seq O O O O O O O

ExDEGA Report, GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.





Poly(A)가 존재하는 생물종을 대상으로 RNA를 분리하여 3’ UTR 부분을 짧게 시퀀싱을 수행하고 유전자 발현 분석을 수행해 드립니다. mRNA expression profiling 분석만을 요구할 시 매우 저렴하게 고품질의 데이터를 제공해 드립니다.

Service Info.
Sample requirement >10ng total RNA
Library method QuantSeq 3' mRNA-Seq Library Prep Kit FWD
NGS run format NextSeq 500, SE 75bp
Data yield >10M read/sample
Turnaround time 4 weeks after RNA QC
Sample type Tissue, Cell, Whole Blood(Paxgene), Plant, Fungi, FFPE, Sorted cell, etc.

++ RNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • RNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis

ExDEGA Report(mRNA expression), GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.





Human, Mouse 샘플을 대상으로 RNA를 분리하여 Ion AmpliSeq RNA 기술을 적용한 NGS을 수행하고 유전자 발현 분석을 수행해 드립니다. 잘 알려진 유전자들의 발현정도를 보다 정확하게 분석해 드립니다.

Service Info.
Sample requirement >10ng total RNA
Library method Ion AmpliSeq RNA Library Kit
NGS run format Ion S5 System
Data yield >7M read/sample
Number of genes Human : 20,802 RefSeq genes
Mouse : 20,767 RefSeq genes + 3,163 XM and XR genes
Turnaround time 3 weeks after RNA QC
Sample type Tissue, Cell, Whole Blood(Paxgene), FFPE, Sorted cell, etc.

++ RNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • RNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis

ExDEGA Report(mRNA expression), GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.





세포, 조직, exosome, body fluid 등에 존재하는 microRNA, piRNA와 같은 small size의 RNA의 양을 NGS 시퀀싱을 통해 분석하고 해당 데이터베이스 기반으로 target gene 분석 및 다양한 데이터 분석을 수행합니다.

Service Info.
Sample requirement >2ug total RNA (Tissue, Cell)
>10ng RNA (Exosome, Bodyfluid)
Library method NEBNext Multiplex Small RNA Library Prep Kit
NGS run format NextSeq 500, SE 75bp
Data yield >20M read/sample
Turnaround time 4 weeks after RNA QC
Sample type Tissue, Cell, Whole Blood(Paxgene), Serum, Plasma, Urine, Exosome, etc.

++ RNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • RNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis

ExDEGA Report(miRNA expression), piRNA profiling, GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.





DNA와 조절단백질과의 상호작용을 분석하고 후생유전학 연구를 위해 매우 유용한 ChIP-Seq 서비스를 제공해 드립니다. 오랜 기간의 실험 노하우와 분석기법을 통해 연구자가 필요로 하는 데이터를 제공해 드립니다.

Service Info.
Sample requirement >20ul IP-DNA, >2ug gDNA
Library method NEB Ultra DNA Library kit
NGS run format NextSeq 500, SE 75bp
Data yield >20M read/sample
Turnaround time 4 weeks after RNA QC
Sample type gDNA, IP-DNA

++ DNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • DNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis

ExDEGA Report, Peak Annotation, Motif Discovery, Tags Comparison, IGV, BedGraph, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.





DNA Methylation 연구를 위해 methyl-CpG-binding domain (MBD) 단백질을 이용하여 methyl DNA를 캡처하고 NGS 수행합니다. 오랜 기간의 실험 노하우와 분석기법을 통해 연구자가 필요로 하는 데이터를 제공해 드립니다.

Service Info.
Sample requirement >2ug gDNA
Library method NEB Methylated DNA Enrichment Kit
NEB Ultra DNA Library kit
NGS run format NextSeq 500, SE 75bp
Data yield >20M read/sample
Turnaround time 5 weeks after RNA QC
Sample type gDNA

++ DNA prep.을 원하실 경우 담당자와 상의하여 진행이 가능합니다.

  • DNA QC
  • Library prep.
  • NGS
  • Data Analysis
  • Report
Data Analysis

ExDEGA Report, Peak Annotation, Motif Discovery, Tags Comparison, IGV, BedGraph, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.