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WinSeurat은 Single cell RNA-Seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램으로, 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Window 환경에서 Single cell RNA-Seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도록 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작하였습니다.
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- Window OS 환경에서 프로그램 구동
- 단일 샘플 또는 여러 샘플을 통합하여 분석 진행 가능
- Single cell data quality control 및 Cell filtering 기능
- Customized UMAP/tSNE Clustering (PCA, Resolution)
- Cluster에서 유의한 Marker gene identification
- Cluster에 대한 개별 Gene expression level 시각화
- Cluster의 Marker gene과 Cell type assignment
- Cluster 또는 Condition에 따른 비교 그룹 분석
- Differential expression 및 Volcano plot visualization
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