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>> LC-MS/MS Proteomics <<
(PTM(Phosphorylation/N-glycosylation) + Global Protein Profiling Service)
| Sample type |
Cell pellet, Tissue, Extracted Proteins |
| Requirement |
1샘플부터 의뢰가능, QC 후 1mg 이상의 protein량 필요 |
| PTM Enrichment kit |
Phospho – IMAC (Immobilized Metal Affinity Chromatography) / Glyco – MAX (Mixed-mode Anion Exchange) |
| Equipment |
LC: Thermo Dionex-Ultimate 3000 / Agilent 1290 | MS: Thermo Q-Exactive |
| Turnaround time |
~ 7 weeks after Protein QC (시료 개수가 많아지면 기간소요가 달라짐) |
| ** Features : PTM 여부 확인 (phosphopeptide & glycopeptide) 및 해당 PTM의 master protein 확인가능, global protein 정량 분석을 같이 진행하여 더욱 효율적인 분석 가능, 의뢰 전 상담 필수 |
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Proteomics Data Analysis
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| >>다양한 DEP 분석 및 Visualization & ExDEGA Report<< |
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Gene Category 분석 및 사용자 맞춤형 protein set 분석
Significant protein대상 GO 그래프 및 filtering
Scatter Plot, Volcano Plot, Heatmap 제공
Venn Diagram 분석 및 해당 영역 protein filtering
KEGG Mapper – Search & Color Pathway Support
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DAVID Functional Annotation Support
Protein-protein Interaction Analysis(String/Cytoscape)
Network & Correlation Analysis
PRIDE Submission 가이드라인 제공
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ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Proteomics 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다. ExDEGA 분석툴은 이바이오젠에서 제공하는 RNA-seq 및 Microarray 데이터(엑셀 파일)에서만 사용하실 수 있습니다.
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