Tumor Microenvironment 연구에 최적화된
GeoMx "Spatial Transcriptome"
실험분석 서비스!
▶ 실험분석 서비스 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
** Service Information **
◈ NanoString사의 GeoMx Digital Spatial Profiler 이용
◈ Heterogeneity 샘플 연구에 효과적
◈ 연구자가 원하는 ROI (Region of interest) 선정 가능
◈ FFPE, Tissue microarray, Fresh frozen tissue, Core needle biopsy 등 Tissue type에 제한이 없음
◈ Whole Transcriptome 발현량 분석 가능 ( Human 기준 18,000개)
◈ Morphology marker를 이용하여 Spatial Gene Expression 연구에 최적화된 시스템
◈ 약 280개의 Publication 보유 / 국내 유일 GeoMx DSP Core Lab & CRO
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Service Name
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GeoMx Spatial WTA Service
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GeoMx Spatial CTA Service
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Species
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Human, Mouse
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Human
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Gene+
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Human ~18,000개 / Mouse ~23,000개
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~1,800개
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Sample type
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Tissue (FFPE, Tissue microarray, Fresh frozen tissue, Core needle biopsy 등)
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Sample size
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14.1 x35.2 mm
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DATA Analysis
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Fastq, ExDEGA report, ROI Images, Spatial Decon, Dimension Reduction(PCA, tSNE, UMAP) 등
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+ WTA(Whole Transcriptome Atlas) 12 AOI(Area-Of-Illumination) 기준, ~100 reads/㎛2
++ CTA(Cancer Transcriptome Atlas) 12 AOI(Area-Of-Illumination) 기준, ~30 reads/㎛2
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GeoMx Spatial Transcriptome Service Process & Figures
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