RE: GeoMx Spatial Transcriptomics 실험 Methods정보 문의

안녕하세요 이바이오젠입니다.

홈페이지를 통해 문의를 주셔서 감사합니다.

문의사항은 담당자에게 전달하여

선생님 이메일 또는 전화를 통해 빠른 답변을 드릴 수 있도록 하겠습니다.

감사합니다.

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안녕하세요.

저는 충북대학교병원 DK Lab의 한상현입니다.

현재 GeoMx DSP 실험 결과를 재현하고 후속 분석을 진행하기 위해 실험 프로토콜을 정리하고 있습니다.

가능하시다면 아래 항목들에 대한 정보를 공유해 주실 수 있을지 문의드립니다.

1. FFPE slide 정보

• 사용하신 slide 종류 또는 coating
  (예: Superfrost Plus, positively charged slide, GeoMx-compatible slide)

2. Target retrieval 및 Proteinase K 처리 조건

• Target retrieval buffer 또는 reagent의 제품명 및 제조사
• Target retrieval 처리 온도 및 시간
• 사용 장비 또는 처리 방법
• Proteinase K 제품명 및 제조사
• Proteinase K working concentration(또는 dilution)
• Proteinase K 처리 온도 및 시간

3. Morphology marker antibody 정보

• SPC/SFTPC, CC10/SCGB1A1, TTF-1/NKX2-1에 사용한 항체의
  • Clone
  • Catalog number
  • Host species
  • Dilution
  • Fluorophore
  • Channel assignment

가능한 범위 내에서 공유해 주시면 실험 재현 및 후속 연구를 진행하는 데 큰 도움이 될 것 같습니다.

바쁘신 와중에도 확인해 주셔서 감사드리며, 회신 부탁드립니다.

감사합니다.

한상현 드림