단백체, 전사체 문의드립니다

안녕하세요

국립낙동강생물자원관 조자영입니다.

펩타이드 독소를 분해(해독)하는 세균 유래 신규 효소를 찾는 연구를 하고 있습니다.

효소를 찾기 위해서 세균의 유전체 분석을 했는데, 효소를 찾지 못했습니다. 

아직 연구가 많이 없어서 예측되는 효소들은 있지만 family가 특정되지 않은 상황입니다.

그래서 유전체 결과를 기반으로 전사체, 단백체 분석을 통해 

펩타이드 독소를 분해하는 신규효소를 찾고자 합니다.

그런데, 저희가 찾고자 하는 효소가

기질에 의해서 발현량이 증가하는게 아니라 activation이 달라지거나 

원래 active 상태로 존재하는 것으로 예측하고 있습니다. 

단백체 분석이 여러가지 있는 걸로 아는데, 

단백질 발현량만 추적 + 활성 추적(?)도 가능한지 문의드립니다.

단백체 분석은 처음이라서 더 효과적인 분석법도 추천해주시면 좋겠습니다.

그리고 홈페이지에는 150ug 단백질이 필요하다고 하는데, 

brandford로 측정해보고 총 단백질량을 맞추면 될까요?

전사체는 키트로 RNA 추출해보고 총량과 순도를 보고 맞추겠습니다.

대략적인 비용도 같이 알려주십시오.

시료는 무처리군, 처리군2개로 총3점이고

반복수는 5회,

단백체(배양액, 세포 각각), 전사체(세포) 분석하려고 합니다.

감사합니다

조자영올림