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유전자 조절 메커니즘 연구의 열쇠, ATAC-seq 서비스 런칭할인

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DNA level에서 유전자 조절 메커니즘 연구의 열쇠
ATAC-seq service 런칭 할인행사!
샘플당 99만원 → 할인가 70만원(부가세별도)
▶ 행사기간 : 2023년 9월 6일 ~ 2023년 11월 30일
▶ 실험분석 서비스 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
ATAC-Seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)
  • 유전자 발현 과정에서 일어나는 염색질(chromatin) 구조적 변화에 따른 접근 가능한 영역을 분석
  • 과활성 돌연변이 Tn5 transposase가 DNA부위를 단편화하고 NGS adaptor Tagmentation을 통해 open chromatin영역을 profiling
  • 최근에는 암, 황반 변성, 세포 분화 환경내에서 특정 유전자의 조절 및 염색체 구조 변화 등과 같은 후성유전학 연구에 활용
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    ** Ebiogen's ATAC-Seq Service **
    ATAC-Seq Service Info. Data Analysis with ExPADA
    Sample Requirement : ~1x106 cells in 1ml media(Cell viability >80%)
    Library Method : ACTIVE MOTIF® ATAC-Seq kit
    NGS run format : NovaSeq 6000, PE 100bp
    Data Yield : ~ 6G/ sample
    Turnaround time :~5 weeks after cell QC
    DATA Analysis : ExPADA report, Peak Annotation, Motif Discovery, IGV, BedGraph 등
  • Gene Ontology 분석
  • Cluster 별 Significant data analysis
  • Volcano Plot 작성 및 gene marking
  • Venn Diagram 분석 및 해당 영역 gene filtering
  • KEGG Mapper – Search&Color Pathway Support
  • MeV Clustering Heatmap Support
  • DAVID Functional Annotation Support
  • Selected genes 발현 패턴 그래프 작성
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    ExPADA & Data Analysis
    ExPADA(Excel based Peak Annotation and Differential enrichment Analysis)는 연구자들이 DNA-Seq (ATAC-Seq) 데이터를 보다 쉽고 직관적으로 다룰 수 있도록 만든 엑셀 기반의 분석 도구입니다. Peak Annotations, Motif results, DA Analysis 등을 제공하고 있습니다.

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