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(2023년 2분기)GeoMx RNA-seq & scRNA-Seq 데이터분석 워크샵 안내

Admin

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Spacial transcriptome & scRNA-Seq 연구자를 위한
GeoMx & RNA-seq / Single cell RNA-Seq
무료 데이터분석 워크샵 안내
  • 대상자 : GeoMx & RNA-Seq, scRNA-Seq 고객 및 국내 연구자
  • 참석인원 제한 : 한 Class에 최대 16명, Lab당 1명
  • 2023년 2분기 분석워크샵 일정
    •   - GeoMx & RNA-Seq : 4월 20일(오전), 5월 18일(오전), 6월 15일(오전)
     - Single cell RNA-Seq : 4월 20일(오후), 5월 18일(오후), 6월 15일(오후)
    이번에 진행하는 분석워크샵은 대면 방식으로 이바이오젠 본사에서 진행하고 원활한 진행을 위해 인원을 제한하오니 양해 부탁드립니다. 더불어 아래 동영상을 미리 시청하고 RNA-Seq 데이터 분석을 예습해 주시면 감사하겠습니다.
    [동영상]ExDEGA v.4.0 & RNA-Seq 데이터분석1(ExDEGA 분석툴 활용, DEG 분석)
    [동영상]ExDEGA v.4.0 & RNA-Seq 데이터분석2(GraphicPlus, Third Party Support)
    **신청방법 및 세부사항**
    신청방법 신청서 작성후 이메일로 신청
    신청서 다운로드(클릭)     		교육시간 오전 9시 30분 또는
    오후 2시(약 3시간 소요)
    분석워크샵 장소 (주)이바이오젠 본사 대회의실
    서울특별시 성동구 뚝섬로17가길 48 성수에이원센터 4층 406호     		준비사항 노트북(마우스 포함)
    프로그램 설치 및 샘플데이터 다운로드(신청확정 후 안내)
    **분석 워크샵 교육내용**
    GeoMx & RNA-seq (오전) Single cell RNA-Seq (오후)
    1. GeoMx Spatial Transcriptome 개요
    2. 분석 실습 1부
     - GeoMx 결과 포맷 & ExDEGA 를 활용한 RNA-seq 발현분석
    3. 분석 실습 2부
     - RNA-seq 추가분석 (GSEA, Cytoscape Network)     		1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석소개
    2. 분석 실습 1부
     - 10x Loupe Browser 활용한 발현분석 및 cell type identification
     - ExSCEA Report 활용한 scRNA 발현분석
    3. 분석 실습 2부
     - WinSeurat 활용한 scRNA-Seq customized option 적용 분석
    ExDEGA & WinSeurat 분석툴
    ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Proteomics 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다.
    WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.

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