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News & Event

(무료 분석워크샵 안내)RNA-Seq & Single cell RNA-Seq 데이터분석

Admin

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News & Event Detail
RNA-Seq & Single cell RNA-Seq 데이터분석
무료 워크샵 일정 안내
대상자 : RNA-Seq, scRNA-Seq 고객 및 국내 연구자
참석인원 제한 : (최대 10명, Lab당 2명 이내)/Class, 한개 Class만 신청가능
코로나19 대응 사회적 거리두기로 최소인원만 교육
RNA-Seq 워크샵은 Advanced Class만 진행하고 기존 Basic Class 워크샵 신청을 원하시는 분은 아래 링크를 통해 동영상을 시청해 주시길 바랍니다.
[동영상]RNA-Seq 데이터분석 워크샵1(ExDEGA, DAVID, KEGG Mapper)
[동영상]RNA-Seq 데이터분석 워크샵2(Clustering, PCA, PPI Network)
2020년 11월, 12월 분석워크샵 일정
▶ RNA-Seq(Advanced) : 11 월 19일(목), 12월 17일(목)
▶ Single cell RNA-Seq : 11월 12일(목), 12월 10일(목)

신청방법 및 세부사항

신청방법 신청서 작성후 이메일로 신청
신청서 다운로드(클릭) 		교육시간 오전 9시 또는
오후 2시(약 3시간 소요)
장 소 (주)이바이오젠 본사
본사위치 : 서울시 영등포구(클릭) 		준비사항 노트북(마우스 포함)
프로그램 설치 및 샘플데이터 다운로드(신청확정 후 안내)

 

분석 워크샵 교육내용

RNA-Seq Advanced Class Single cell RNA-Seq
ExDEGA 분석툴 유경험자 대상으로 GSEA, MeV, Cytoscape 프로그램 교육
- 1부 -
  • ExDEGA 데이터분석 개요
  • MeV(Clustering) 프로그램 활용
  • GSEA 프로그램 활용
    • - 2부 -
  • Cytoscape-String Network 활용
  • Cytoscape-ClueGO 활용
  • Cytoscape-Custom Network 활용
    		•  1. scRNA-Seq 개요 : scRNA-Seq 소개, 전반적인 이론 및 분석(Cell Ranger, Seurat) 안내
    2. ExSCEA 이용 발현분석 : Cell Ranger 분석 기반의 ExSCEA, Loupe를 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
    3. WinSeurat 활용 : WinSeurat 분석툴을 활용한 scRNA-Seq 분석 실습
    (QC, Normalization, PCR, SCTransform, Integration, Clustering, Marker Identification, DE Analysis)

     

    분석워크샵 신청 및 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
    ExDEGA & WinSeurat Screenshot
    ExDEGA(Excel based Differentially Expressed Gene Analysis) 분석툴은 연구자들이 엑셀 기반으로 RNA-Seq 또는 Microarray 데이터를 보다 쉽게 직관적으로 다룰수 있어 원하는 데이터를 쉽고 빠르게 얻을수 있도록 사용자 편의를 최대한 반영한 분석툴입니다.

    WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.

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