SERVICE
RNA-Seq
Total RNA-Seq / mRNA-Seq
Genome Sequencing이 완료된 생물종을 대상으로 RNA를 분리한 후 NGS 기술을 통해 전사체(transcriptome) 분석을 수행해 드립니다. mRNA expression profiling 분석 외에도 lncRNA, isoform, Splicing Variant, GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA 등 다양한 분석을 지원합니다.
Service Feature
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total RNA-Seq |
mRNA-Seq |
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Sample requirement |
>2µg total RNA |
>2µg total RNA |
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Library method |
RiboCop rRNA Depletion kit + CORALL RNA-seq Library Prep kit |
Poly(A) RNA Selection kit + CORALL RNA-seq Library Prep kit |
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NGS run format |
NextSeq, PE150bp |
NextSeq, PE150bp |
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Data yield |
> 9 Gb/sample |
> 6 Gb/sample |
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Turnaround time |
~3 weeks after RNA QC |
~2 weeks after RNA QC |
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Sample type⁺ |
Tissue, Cell, Whole Blood(Paxgene), Plant, Fungi, etc. |
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+ RNA prep. 서비스가 필요한 경우 상담을 통해 진행 가능합니다.
| Basic Analysis | Optional Analysis | ||||
| Lnc RNA | mRNA Expression | Isoform Expression | INDEL/SNP Analysis | Splicing Variant | |
| Total RNA-Seq | O | O | O | O | O |
| mRNA-Seq | O | O | O | O | |
Progress
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1
RNA QC
-
2
Library prep.
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3
NGS
-
4
Data Analysis
-
5
Report
Data Analysis
ExDEGA Report(mRNA expression), GO, Pathway, Clustering, Network, GSEA, Data Mining 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.