SERVICE

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Single Cell RNA-Seq

Illumina Single Cell RNA-Seq

Illumina의 Single cell RNA-Seq 서비스는 PIP-Seq 방식을 통해 GEM을 형성하고, Illumina의 DRAGEN 파이프라인으로 데이터를 분석합니다. 분석 결과는 자사 Single cell RNA-Seq 표준 결과물 형식으로 제공되며, Gene expression matrix, Clustering, UMAP 시각화 등 주요 분석 데이터가 포함됩니다.

Service Feature

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Sample requirement Cell line, Primary cell, FACS sorted cell : 500,000 cells (Viability > 70%)
Tissue : Fresh Tissue 200 mg 이상 (in MACS buffer)
Library method Illumina single cell 3’ RNA-Seq preparation
Number of Target cell 10,000 cells, 20,000 cells
Data yield ~30,000 Paired reads per cell
Turnaround Time ~4 weeks after Cell counting & QC
Data analysis QC Report, Gene expression data, UMAP, t-SNE, Feature selection PCA, Clustering heatmap 등 (Dragen 기반 분석 제공)

+ Tissue Dissociation 과정은 추가 비용이 발생하며 별도 상담이 필요합니다.
+ Data yield는 상담을 통해 변경하여 적용 가능합니다.

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Progress

  • 1

    Tissue dissociation

  • 2

    Cell QC

  • 3

    GEM & Library prep.

  • 4

    NGS

  • 5

    Data Analysis & Report

Data Analysis

Illumina에서 제공하는 Dragen 파이프라인에 대한 분석을 기본적으로 지원하며, 이바이오젠에서 직접 개발, 제작한 ExSCEA와 WinSeurat을 통해 Cluster 기반 비교 분석 및 Cell type DE 분석 등을 다양하게 제공합니다.

Service VIDEO