SERVICE
DNA-Seq
Metagenome(Shotgun Seq.)
Metagenome 서비스는 토양, 공기, 물, 인체시료 등의 다양한 환경에서 채취되는 시료내에 어떠한 생물(Bacteria, Fungi 등)들이 얼만큼 존재하는지를 NGS 기술을 적용하여 분석하는 서비스입니다.
Shotgun metagenome Sequencing은 특정 영역(16S, 18S, ITS1/2)에 제한되지 않고, 샘플 내 모든 gDNA를 분석하는 서비스입니다. NGS 기술을 적용하여 박테리아, 곰팡이, 바이러스 등 다양한 미생물을 동시에 식별하고 정밀하게 프로파일링할 수 있습니다.
Shotgun metagenome Sequencing은 특정 영역(16S, 18S, ITS1/2)에 제한되지 않고, 샘플 내 모든 gDNA를 분석하는 서비스입니다. NGS 기술을 적용하여 박테리아, 곰팡이, 바이러스 등 다양한 미생물을 동시에 식별하고 정밀하게 프로파일링할 수 있습니다.
Service Feature
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Sample requirement |
>5µg gDNA, >50ng/µl gDNA, >4 DIN |
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Library method |
NEB Ultra DNA Library kit |
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NGS run format |
NovaSeq, PE150bp |
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Data yield |
~10Gb/sample⁺ |
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Turnaround time |
~4 weeks after DNA QC |
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Sample type |
gDNA⁺⁺ |
+ 위 안내된 내용은 fecal 기준으로, 이 외 샘플타입은 별도 상담이 필요합니다.
++ gDNA prep. 서비스가 필요한 경우 상담을 통해 진행 가능합니다.
Progress
-
1
DNA QC
-
2
Library prep
-
3
NGS
-
4
Data Analysis
-
5
Report
Data Analysis
ExMEGA Report, Assembly Result, Feature Table, Taxonomy(Bar & Pie Chart, Profile Data), Diversity(Alpha, Beta), Sample Clustering 등의 다양한 분석을 지원해 드립니다.