Title Single Cell RNA-Seq 분석툴, WinSeurat v.2.0 소프트웨어 및 메뉴얼
Writer Admin
Date 2020-06-11
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WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다. 

# WinSeurat v.2.0 설치파일 및 메뉴얼#

# WinSeurat 주요기능# 

  • Windows OS 환경에서 프로그램 구동
  • 단일 샘플 또는 여러 샘플을 통합하여 분석 진행
  • Single cell data quality control 및 Cell filtering
  • Customized UMAP/TSNE Clustering (PCA, Resolution)
  • Cluster에서 유의한 Marker gene identification
  • Cludter에 대한 개별 Gene expression level 시각화
  • Cluster의 Marker gene과 Cell type assignment
  • Cluster 또는 Condition에 따른 비교그룹 분석
  • Differential expression 및 Volcano plot visualization