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Title Single Cell RNA-Seq 분석툴, ExSCEA & WinSeurat 출시 및 무료배포
Writer Admin
Date 2020-05-07
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NEWS Detail
Single Cell RNA-Seq 분석툴,
"ExSCEA & WinSeurat"
출시 및 무료배포 안내
Single Cell RNA-Seq 데이터 분석을 쉽고 빠르게 처리하고
다양한 데이터 시각화를 지원해 드립니다.
이바이오젠 고객이면 무료로 사용이 가능하며 아래 샘플데이터로 체험해 보세요!

 

ExSCEA 주요기능
 WinSeurat 주요기능
- HVG (Highly Variable Genes), Cell Type, Gene Ontology 분석
- Cluster 별 Significant data analysis
- Volcano Plot 작성 및 gene marking
- Venn Diagram 분석 및 해당 영역 gene filtering
- ExDEGA GraphicPlus 연동 및 기능사용
- KEGG Mapper – Search&Color Pathway Support
- MeV Clustering Heatmap Support
- DAVID Functional Annotation Support
-Selected genes 발현 패턴 그래프 작성 		- Windows OS 환경에서 프로그램 구동
- 단일 샘플 또는 여러 샘플을 통합하여 분석 진행
- Single cell data quality control 및 Cell filtering
- Customized UMAP/TSNE Clustering (PCA, Resolution)
- Cluster에서 유의한 Marker gene identification
- Cludter에 대한 개별 Gene expression level 시각화
- Cluster의 Marker gene과 Cell type assignment
- Cluster 또는 Condition에 따른 비교그룹 분석
- Differential expression 및 Volcano plot visualization

 

** ExSCEA & WinSeurat 설치파일 및 메뉴얼 **
아래 파일들을 다운받아 설치하시면 ExSCEA와 WinSeurat 분석을 체험하실 수 있습니다.

ExSCEA v.1.0
 WinSeurat v.2.1
  • [Down] ExSCEA v.1.0 Install File
  • [Down] ExSCEA User Manual
  • [Down] ExSCEA Sample Data
    		•
  • [Down] WinSeurat v.2.1 Install File
  • [Down] WinSeurat User Manual
  • [Down] WinSeurat Trial Version
    		•
    Loupe(provided by 10xGenomics)
  • [Down] Loupe Install File
  • [Down] Loupe User Manual
  • [Down] Loupe Sample Data
    		•

     

    데이터분석 및 서비스 문의 : 02-3141-0791, service@e-biogen.com
    ExSCEA Screenshot
    ExSCEA(Excel based Single Cell Expression Analysis)는 연구자들이 Single cell RNA-seq 데이터를 보다 쉽고 직관적으로 다룰 수 있도록 만든 엑셀 기반의 분석툴입니다. Single cell RNA-seq 분석을 ExSCEA로 유의미한 데이터를 간편하게 만드실 수 있습니다.

    WinSeurat Screenshot
    WinSeurat은 Single cell RNA-seq 분석에서 기본적인 조건 이외에 연구자가 원하는 분석 조건을 입력하여 보다 정교한 분석을 진행할 수 있는 프로그램입니다. WinSeurat은 리눅스 환경에 익숙하지 않은 연구자들이 Windows 환경에서 Single cell RNA-seq 분석을 쉽게 수행할 수 있도 Seurat이라는 R 패키지 프로그램을 개조하여 제작되었습니다.

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